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Espace Étudiants : Banque de Questions/réponses

Sélection actuelle : BCM-2003-A Sélectionner : Toutes les sections BCM - Questions générales BCM-1501-A Section générale- Origine biochimique de la vie BCM-1502 Métabolisme I BCM-1503 Acides nucléiques et génétique 1 BCM-1521 Partie Théorique-Travaux pratiques de biochimie 1 BCM-2501 Protéines BCM-2504 Enzymologie BCM-3514 Régulation de l'expression génique GEN - BIBLIO Recherche Bibliographique Rechercher le mot : ou le # de Question : Il y a 1 éléments répertoriés.  Précédent | 1 | Suivant
BCM-2003-A Envoyée par : Étudiant(e) Bioinformatique Répondue par : Béatrice Roure 2008-02-12 Question #474 Comment obtenir la taille des arbres inférés et la vraisemblance totale par la méthode de maximum de vraisemblance, par paup et phyml ? (la commande Describetrees ne fournit pas l'information dans paup) Réponse Bonjour, Si Describetrees ne donne pas la vraisemblance (likelihood en anglais), c'est que l'inférence n'a pas été faite par maximum de vraisemblance (le type d'inférence est affiché dans le résultat de describetrees). Pour afficher la taille de l'arbre, il faut la demander à PAUP en fournissant le bon paramètre à la commande describetrees, il s'agit de brlen (voir l'aide en ligne) Pour PhyML, les résultats sont dans les fichiers de sortie Béatrice Informations Question consultée 4196 fois. | 3296 votes, Moyenne 3/5.0 | À vous de voter => min max
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