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BCM-3514 Envoyée par : Étudiant(e) Biochimie Répondue par : Marieke Rozendaal 2010-02-20
Question
#535
1) Pourquoi la méthylation de l'ADN a lieu exclusivement sur les cytosines dans les îlots CpG?

2) Pouquoi la méthylation de l'ADN et des histones ont lieu souvent dans le cas de l'hétérochromatine?

3) Vous pouvez me expliquer c'est quoi le controle negatif? J'ai des misères à comprendre ce controle.

4) Pourquoi dans le FootPrinting, le fragment d'ADN lié à facteur de transcription ne donne pas le bande sur le gel?
Merci bcp!
Réponse Bonjour,

1) Si j'ai bien compris la question est pourquoi les cytosines dans les îlots CpG sont méthylés et pas ceux en dehors des îlots CpG... Alors premièrement, les cytosines qui ne sont pas dans les îlots CpG peuvent être méthylés aussi, ça arrive juste beaucoup moins souvent. La grande majorité des 5-méthylcytosines se trouvent dans les îlots CpG. Maintenant pourquoi... J'avoue que c'est moins facile a répondre. Je n'ai pas trouvé de réponse satisfaisante et je ne suis pas certaine que ce soit connu. Je vais vérifier avec Dr. Mader.

2) Le terme hétérochromatine signifie la chromatine condensée, transcriptionellement inactive. C'est donc logique qu'on trouve souvent des marques de repression transcriptionelle (ADN méthylé, histones désacétylées, méthylées) dans ces régions. Mais attention! Bien que la plupart de temps les histones méthylées sont associées avec une repression transcriptionelle, il y a des exceptions, notamment la méthylation de la lysine-4 de l'histone 3 qui est associée avec une activation transcriptionelle!

3) Je ne sais pas si tu parles d'une expérience en particulier? De façon générale le contrôle négatif est un contrôle qui nous permet de voir le niveau basal de signal dans une expérience. Par exemple si on regarde la régulation de la transcription d'un ligand, le contrôle négatif sera une condition sans traitement. Le contrôle négatif est souvent utilisé comme bruit de fond, par exemple dans des dosages de protéine par spectrométrie, où on inclut une condition avec uniquement le tampon de lyse. Si tu veux plus de détails sur un manip en particulier, laisses-moi le savoir. (idéalement avec numéro de diapo...)

4) Peux-tu me préciser le numéro de la diapo? J'ai de la misère à me retrouver dans les notes de cours.....

Bonne continuation,
Marieke.

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