Tutorat en ligne de l'Agora du Département de biochimie: Banque de Questions/réponses : Impression

BCM - | Questions générales | Question #588

Envoyé par : Etudiant(e) Mineur Arts et Sciences Répondu par : Marieke Rozendaal  2011-02-20
bonjour tuteurs

je ne saisis pas bien l'acidose et l'alcalose au niveau de la derniere slide du cours d'introduction bcm1531. en cas d'Acidose,l'augmentation des protons entraine la baisse pH. telle que l'illustre un emphysème pulmonaire.mais en cas d'alcalose,je ne comprends pas très bien le lien entre le CO2 et le l'augmentation du PH.

merci d'avance pour votre aide
Bonjour,

Désolée pour le retard, il y avait un problème avec le site du Tutorat, qui a fait que j'ai pas reçu la question avant.

Je n'ai pas accès aux notes pour le cours BCM1531, mais je pense que je peux l'expliquer pareil.

Il faut regarder les réactions qui contrôlent le pH dans le sang. Ce sont toutes des réactions à l'équilibre:

CO2 + H20 <==> H2CO3 <==> H+ + HCO3-

Une diminution de la concentration de CO2 dans le sang, causée par exemple par une hyperventilation, va déplacer l'équilibre vers la gauche. Donc, le HCO3- va fixer les protons (H+) et le pH va augmenter.

Recontactes-moi si ce n'est pas clair,

Bonne chance

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #587

Envoyé par : Rodrigo Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-12
Bonjour, j'aimerais mieux comprendre quelle est la rélation entre le dolichol phosphate et l'isoprène...

Merci à l'avance!

Rodrigo ;)
le dolichol est composé d'unités isoprènes

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #586

Envoyé par : Étudiant(e) Bioinformatique Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-12
Bonjour, je voulais savoir ce qu'est une ancre membrannaire exactement.

merci
Une ancre membranaire est un groupement de sucres et de lipides qui permettent de fixer une protéine à la membrane.

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #585

Envoyé par : Étudiant(e) Biochimie Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-12
Bonjour
Je veux juste savoir si il faut apprendre les enzymes qui permet de determiner la sequence en acide amine d'une proteine primaire (1er cours sur les proteines avec Mme Aubry). (i.e. la carboxypeptidase coupe a droite d'un aminoacide et detruit Trp, etc.)
Merci
Les tableaux de spécificités seront fournis à l'examen. Cependant, il faut comprendre comment les différents types d'enzymes coupent. (ex. carboxypeptidase coupe au c-terminal).

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #584

Envoyé par : daniela Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-12
Bonjour, j'ai quelques questions concernant la partie Christian Baron

1) Je n'ai pas compris - le « PHOTOBLEACHING»

- FRET

- application de la GFP

- la technique «PATCH CLAMP»

Merci
Cette question est très large alors je vais devoir donner des réponses assez générals.

Photobleaching: C,est une technique par laquel on utilise un laser pour détruire une partie de lipides qui compose la membrane cellulaire. En marquant les lipide avec un composé fluorescent, il est alors possible de mesurer le temps nécessaire pour la cellule pour réparer le trou créé dans sa membrane. Ce test permet d'évaluer la fluidité membranaire. En effet, plus une membrane est fluide, plus rapidement elle pourra boucher le trou.

GFP: La GFP est une protéine fluorescente utilisée pour marquer des cellules ou des protéines. De cette façon, il est possible de localiser ce que l'on désire en l'excitant avec une lumière de longueur d'onde appropriée.

FRET: Technique utilisant les caractéristiques des protéines fluorescentes pour évaluer l'intéraction entre deux protéines. Brièvement, deux protéines d'intérets sont couplées à différentes protéines fluorescentes. Si les deux protéines intéragissent, lorsque l'on stimule à l'aide d'une lumière à une longeur d'onde particulière à l'une des protéines, on observera une fluorescence de la couleur de la deuxième protéine (du à un transfert d'énergie entre les protéines à cause de leur proximité). De cette façon, on sait que les deux protéines intéragissent.

Exemple: Protéine1 couplée à une protéine fluorescente bleu
Protéine 2 couplée à une protéine fluorescente jaune.
Si l'on stimule la protéine fluorescente bleu et que les deux protéines intéragissent on remarque l'émission d'une fluorescence jaune.
Si les deux protéines n'intéragissent pas, on observera une fluorescence bleu.

Patch Clamp: C'est une technique qui permet de vérifier le potentiel d'une membrane à faire traverser des ions. À l'aide d'électrode, il est ensuite possible de quantifier le passage d'ions à l'aide du potentiel électro-chimique généré.

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #583

Envoyé par : Étudiant(e) Biochimie Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-12
Bonjour,

J'ai pas bien compris le role de l'aspirine et de l'ibuprofene en rapport avec la Prostaglandine H2.

Merci de m'expliquer.


L'aspirine et l'ibuprofène bloquent le canal hydrophobe de la protéine menant à son site actif (lieu de la production de prostaglandine). Lorsque ce canal est bloqué, il est impossible pour la protaglandine H2 synthase de produire de prostaglandineH2. La prostaglandineH2 est une molécule de signalisation pour l'inflammation. De cette façon, l'aspirine et l'ibuprofène inhibent l'inflammation en empêchant la formation de prostaglandineH2.

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #582

Envoyé par : Mariam H. Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-11
Bonjour,

Dans les canaux ionique de potassium, j'ai mal compris pourquoi les ions Na+ ne peut traverser a travers le canal? Pourquoi est-il rejete si son rayon est plus petit que celui du K+?( 0.95 A)

La spécificité vient de la solvatation. En effet, la taille des deux ions est très différentes une fois en complexe avec les molécules d'eau. Les canaux K+ ne peuvent désolvater que les ions K+. Bref, les ions seuls (Na+ et K+) pourraient passer dans le canal, mais il faut comprendre qu'en milieu acqueux les ions possèdent une coque d'eau et que celle-ci sera spécifiquement enlevé par son canal (permettant le passage de l'ion).

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #581

Envoyé par : Gabrielle Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-11
Bonjour,

Concernant le GFP qui code pour la fluorescence, quelle est a différence entre le gènes de fusion I et le gène de fusion II ?

Merci
Gène de fusion I et gène de fusion II ne sont que les titres des diapositives. La diapositive gène de fusion II décrit en détail l'allure des gènes de fusions avec la GFP.

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #580

Envoyé par : Yasmine Gourramen Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-11
Dans les diapositives de transport à travers les membranes 1, ça parle du fait que l'inhibition de la déphosphorylation et la diminution du gradient de Na+
a un impact sur les pompes Ca2+ Atp-ase

.. comment l'impact se déroule t'il en fait?

Merci

La déphosphorylation de la pompe limite le transport actif du CA2+ par les pompes. Ensuite, le gradient Na+ augmente le potentiel électrochimique de la cellule. Plus ce potentiel est élevé, plus on a besoin d'énergie pour faire entre des ions dans positivemement chargés (peu importe lequel) à l'intérieur de la cellule.

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BCM-1501-A | Section générale- Origine biochimique de la vie | Question #579

Envoyé par : Étudiant(e) Biochimie Répondu par : Etienne Lepage  2010-12-11
Bonjour,

Sur une des diapositives de M. Aubry, il y a une figure où l'on attribue à une chaîne de deux acides aminés le côté C-terminal et le côté N-terminal. Comment je peux savoir lequel est lequel?

Merci
Je ne sais pas tout à fait quel exemple vous mentionnez. Cependant, il faut savoir que lorsque l'on nomme les acides aminées d'une protéine, on commence toujours par celle en N terminale. Sinon, lorsque représente la protéine sous forme atomique, il faut être capable de repérer le groupement NH2 libre (qui correspond au N-term).

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