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BCM-2003
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Envoyée par : Louis-Philippe Lemieux Perreault
Répondue par : Félix Doyon
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2004-03-10
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Question
#103
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Pour le devoir 5 de BCM2003, il est dit que les scores changent, mais mes scores ne changent pas même après avoir enlevé le dernier acide aminé de la séquence no. 2. Est-ce normal? |
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Réponse
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Bonjour,
Je crois savoir d'où proviennent les différences. Par exemple, j'ai fait la comparaison des séquences avec FASTA en ligne, et effectivement, tel que tu l'affirmes, les 'scores' ne changent pas. C'est la même chose pour la version téléchargée et exécutée localement. Par contre, avec une version plus ancienne d'un an, les 'scores' changent de façon draconienne. Aussi, les résultats par défaut en disent plus long sur l'exécution du programme. L'exercice a été bâti avec cette version et c'est regrettable mais en tout et partout, cette inconsistance ne change rien à l'idée du devoir 5. Cet exemple était supposé vous illustrer qu'un petit changement peut mener à des résultats très différents, et que le programme FASTA possède certaines inconsistances.
Je vous encourage donc à 'jouer' le plus possible avec le programme FASTA afin d'en découvrir le fonctionnement le plus en détail possible. C'est en fait ce que l'on vous demande de faire.
Bon travail.
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