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BCM-1501-A
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Envoyée par : Véronique Lisi
Répondue par : Constance Couture
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2004-09-27
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Question
#155
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Plusieurs petites questions pour l'examen:
1- Y-a-t'il une nomenclature spéciale pour les peptides? (e.g.:AG est desoxyadénosie desoxyguanosine)?
2- Ds un lien phosphoester, le phosphate de l'extrémité 5' doit-il avoir un H? HO - POO- O - CH2...
3- Je voudrais confirmer que pour les conformations alpha et Bêta, la règle qui s'applique, que ce soit L ou D est: groupements opposés: alpha, sinon bêta
4-Dans les notes de cours, la page intitulé "Transition Fischer - Chaise", le C1 ne devrait-il pas avoir le H en haut et le OH en bas?
Merci beaucoup et j'espère que ce n'était pas trop de questions. |
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Réponse
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Bonjour,
1. Tu mélanges 2 choses: l'exemple que tu donnes implique des nucléotides. Dans certains livres, tu peux trouver une nomenclature, mais nous n'en avons pas vues dans ce cours. Tout ce qu'il faut savoir c'est que l'aa identifié en premier forme l'extrémité N-terminale et le dernier aa forme l'extrémité C-terminale. Ainsi, pour un dipeptide AV, par exemple, le lien peptidique est formé entre le carboxyle de l'alanine et l'amine de la valine.
En ce qui concerne les acides nucléiques, nous n'avons pas vu de nomenclature non plus. En fait, il y a seulement pour les sucres que nous avons vus une nomenclature assez élaborée et qu'il faut bien connaître.
2. Les O liés à ton P, à part celui lié par une double liaison peuvent être protonés ou non dépendamment du pH de la solution. Dans l'examen, tu as le choix, mais toute ta molécule doit être conséquente, c'est à dire que si tu protone un groupement, il faut que tu protone les groupements logiquement protonés dans les mêmes conditions. Aussi, ta façon d'écrire ton groupement phosphate n'est pas très bonne: HO - POO- O - CH2...; tu aurais dû écrire: (HO)2 - PO- O - CH2...
3. Exact: quand tu parles de groupement opposés, il s'agit du carbone exocyclique le plus loin du carbone anomère et le OH sur le carbone anomère.
Si tu as d'autres questions, nous serons disponible en ligne ce soir avant l'examen.
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