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BCM-1501-A
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Envoyée par : Johanne Landry
Répondue par : Constance Couture
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2004-10-08
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Question
#161
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À propos de WEBCT, pour répondre à la question #1, j'ai «collé» ma séquence en format FASTA dans restrict et j'ai coché la case approprié (solofragments).
La problème, c'est que je ne suis pas sûr que «minimum lenght of recognition site» veut dire nombre de fragment. J'aimerais savoir si c'est bien le cas. Sinon, quel est le terme que je dois rechercher.
Merci infiniment |
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Réponse
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Bonjour,
Le «minimum length of recognition site» réfère aux nombre de bases reconnu par une enzyme de restriction.
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Minimum recognition site length (-sitelen)
This sets the minimum length of the restriction enzyme recognition site. Any enzymes with sites shorter than this will be ignored.
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Certaines enzymes ont des sites de restriction de 4 base, d'autres 6 et d'autres plus encore. Si tu spécifies 8 dans la boîte de texte, cela veut simplement dire que le logiciel ne tiendra pas compte des enzymes de restriction dont le site de restriction est inférieur à bases.
Pour répondre à la question, tu dois trouver le nombre de fois que coupe les enzymes spécifiées et déduire le nombre de fragments obtenus. Le programme t'indique la taille des fragments obtenus suite à une digestion enzymatique et c'est cette information qui te permettra de répondre à la question.
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