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BCM-3514
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Envoyée par : Thomas Morse
Répondue par : Marieke Rozendaal
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2009-02-20
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Question
#516
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J'ai une question concernant les documents 3.4 de Sylvie Mader
Que veux dire le fold difference, à la 2e diapo de la page 7 et 1ere diapo page 8
Je ne comprend pas la conclusion H3 MeK9 a une distribution complémentaire ?
Une distribution de quoi ??? (je comprend visuellement ce qu'on entend par complémentaire)
Les deux modifications sur MeK9 sont incompatible ??? Cela revient à mon incompréhension du Fold différence, en quoi est-ce qu'il sont incompatible ???
Merci
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Réponse
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Bonjour,
Pour la première partie de la question:
Le fold difference est utilisé comme façon de comparer les résultats obtenus par des expériences de précipitation de la chromatine. Les auteurs ont normalisé les données pour que la valeur maximale soit 1 et la valeur minimale 0. Ceci facilite la comparaison des données, par exemple pour la courbe de Me/K9 on peut voir qu'à 15kb la quantité d'ADN précipité est 75% du maximum (observé à 10kb). On peut donc conclure que la modification Me/K9 est moins présente à 15kb qu'à 10kb (25% moins).
Regardons maintenant la figure à gauche pour répondre à la dernière partie de la question. Sachant que plus la courbe s'approche à 1, plus la modification est présente; on peut clairement voir que quand les niveaux de Me/K9 sont élevés, les niveaux de Ac/K9 sont bas et vice versa. Delà donc la conclusion que les deux modifications sont incompatibles.
En fait ceci répond toute de suite à la deuxième partie de la question. La modification Me/K9 est complémentaire avec la Ac/K9, on ne les voit jamais en même temps. (Et on peut constater que la modification Me/K9 est associée avec la chromatine condensée, donc inactive.)
J'espère que tout ça répond assez bien aux questions.
Bonne continuation.
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