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BCM-2501
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Envoyée par : Jonathan Poulin
Répondue par : Alexandre Viau
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2004-02-23
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Question
#91
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Salut Alexandre,
Est-il possible de faire la distinction entre une hélice alpha et un feuillet béta par spectre COSY? |
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Réponse
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Bonjour à tous,
Tout d'abord, le principal type de spectre RMN nous permettant de faire la distinction entre un feuillet beta et une hélice alpha est le spectre NOESY.
Donc, le spectre NOESY comme vous le savez, détecte le couplage entre les hydrogènes situés à proximité dans l'espace. Ainsi, si l'on observe la structure 3D d'une hélice alpha (disponible dans vos notes) vous verrez que les hydrogènes liés à l'azote du lien peptidique de chaque acide aminé sont tous orientés de façon à ce qu'ils soient près l'un de l'autre dans l'esapce. Ceci se traduit par un fort couplage NH-NH visible par spectre NOESY. C'est la caractéristique la plus diagnostique des hélices alpha.
Pour ce qui est des feuillets beta, les hydrogènes qui sont le plus rapprochés dans l'esapce sont l'hydrogène du carbone alpha du résidu (i) et l'hydrogène de l'azote du résidu (i+1). Vous pourrez vous-mêmes remarquer cela en regardant la structure 3D d'un feuillet beta ou à l'aide d'un modèle plastique. C'est donc ce pic de corrélation qui est le plus caractéristique des feuillets beta.
Je vais illustrer le tout lors de mon exemple sur l'assignation séquentielle. Je vous remets ici la figure fournie par le Dr Michnick qui résume les différences principales entre les spectres NOESY des hélices alpha et des feuillets beta.
Merci pour vos questions!
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