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BCM-2003
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Envoyée par : François Gauthier
Répondue par : Félix Doyon
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2004-03-01
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Question #96
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Pour la question #1 de la deuxième partie du devoir #4 portant sur l'algorithme de retraçage, est-ce qu'on doit faire un algorithme d'alignement local ou global avec/sans pénalité en bout de séquence? |
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Réponse
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Bonjour,
Idéalement, il s'agirait de définir une procédure de retraçage pour un alignement local. Par contre, le problème est sensiblement le même pour obtenir un alignement global, global sans pénalités en bout de séquence ('end-gap penalties') ou bien un alignement local, à quelques différences près. Je crois que si vous êtes capable de construire la procédure de retraçage pour l'un des trois, les autres devraient devenir beaucoup plus claires.
Bon travail.
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