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Sélection actuelle : BCM-2003

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BCM-2003 Envoyée par : François Gauthier Répondue par : Félix Doyon 2004-03-01
Question
#96
Pour la question #1 de la deuxième partie du devoir #4 portant sur l'algorithme de retraçage, est-ce qu'on doit faire un algorithme d'alignement local ou global avec/sans pénalité en bout de séquence?
Réponse Bonjour,

Idéalement, il s'agirait de définir une procédure de retraçage pour un alignement local. Par contre, le problème est sensiblement le même pour obtenir un alignement global, global sans pénalités en bout de séquence ('end-gap penalties') ou bien un alignement local, à quelques différences près. Je crois que si vous êtes capable de construire la procédure de retraçage pour l'un des trois, les autres devraient devenir beaucoup plus claires.

Bon travail.

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