Envoyé par : Steve Lawrence
Répondu par : Béatrice Roure
|
2005-02-06 |
|
re: "Pour la question 3.2 Positions informatives:
Apres avoir fait le PRODTIST + NEIGHBOR, il est demande de faire un test BOOTSTRAP, alors comment le fait-on?" Je sais que je dois faire les tests protdist + neighbor sur "mito-12prot-info.phy" et "nuc-16prot-info.phy". Mais qu est ce que je fais avec les resultats? Pour le test de bootstrap est-ce que je dois utiliser "mito-12prot-info.phy" et "nuc-16prot-info.phy".( les fichiers originaux) ou les outfiles de neighbor des tests precedents. Je vous demandes ce question parce que j'ai pas compris la reponse a l'autre question qui etait semblable. merci |
|
|
Pour completer la reponse a la question #194 : il faut bien sur utiliser les jeux de donnees contenant uniquement les positions informatives pour toutes les etapes de la partie 3.2 , soit
- l'inference par PROTDIST+NEIGHBOR - le test du bootstrap : SEQBOOT +PROTDIST+NEIGHBOR + CONSENSE Pour etre valable le test du bootstrap doit etre fait dans les memes conditions (c'est a dire memes donnees, meme methode et memes options) que l'inference initiale Le chapitre 6 (en anglais) donne dans les lectures traite notamment de la confiance que l'on peut mettre dans un arbre et des moyens pour tester cette confiance |
|
Question consultée 5335 fois. | 4160 votes, Moyenne 3/5.0
|  Retour aux questions | |
|