Envoyé par : Steven Lawrence
Répondu par : Béatrice Roure
|
2005-02-06 |
|
!) Question de vocab
vocabulaire : un noeud = une branche ou groupements de branches "groups" = noeuds en anglais? C'est correct? 2) pour le Compte Rendu : est-ce que un pourcentage de mieux que 50% signifie un noeud robuste? 3) Est-ce que je puisse utiliser les arbres trouver dans le "outfile" comme preuve de robustesse? Merci pour toute votre aide je l'apprecie beaucoup! Steve |
|
|
1)Pour le vocabulaire de base en phylogenie (et en anglais), le Chapitre 2 du livre de Page donne dans les lectures semble tout indique
Simplement, un arbre est compose de noeuds (nodes) connectes par des branches (edges); les noeuds terminaux sont appeles feuilles (leaves) et correspondent aux especes. Chaque noeud correspond a une bipartition des especes. 2) Comme precise dans le cours, le pourcentage de robustesse a retenir dans le cas d'un test de bootstrap est de 95% si on s'en tient a la rigueur statistique; cependant, on se contente souvent d'une valeur de 70% 3) Bien sur, c'est le meme arbre avec les memes valeurs de bootstrap qui est retrouve dans les fichiers "outfile" et "treefile". Les 2 fichiers ne different que par le format de l'arbre : - format texte lisible a l'oeil nu dans outfile - format arbre parenthese qui necessite un outil de visualisation dans treefile Remarque: des informations complementaires sont egalement disponibles dans "outfile" |
|
Question consultée 5433 fois. | 4354 votes, Moyenne 3/5.0
|  Retour aux questions | |
|