Envoyé par : Steve Lawrence
Répondu par : Béatrice Roure
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2005-02-11 |
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pour le exercise 3
quand je rentre "mammalia-mito.tre" dois je seulement changer l'option "u" ou changer tous les options comme dans"mito-12-prot.phy" eg "D,I,M,R, A, N 0.3, Y" Je l'essayais des deux facons et ca ma donnais ". Problem with sequence format" merci Steve |
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il faut utiliser toutes les options avec l'option U en plus, pour preciser l'arbre que PHYML doit utiliser en entree pour proceder aux echanges de NNI
Entre les 2 inferences par PHYML sur le jeu de sequences mitochondriales, l'arbre initial est le seul parametre qui doit doit varier Pour le message d'erreur, je ne vois pas de probleme : je viens de refaire tout le protocole a partir du telechargement des donnees sur le site web et je n'ai pas d'erreurs. Il faut peut-etre telecharger a nouveau les donnees au cas ou le fichier serait abime. |
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