Tutorat en ligne de l'Agora du Département de biochimie: Banque de Questions/réponses : Impression

BCM-2003-A | Section Phylogénomique- Application d'outils bio-informatiques | Question #206

Envoyé par : Michaël Auger-Lafond Répondu par : Béatrice Roure  2005-02-12
Puis-je avoir une explication de base sur l'exercice papier du dernier cours de phylogénie ?

De même, un exemple de la technique a utilisé pour dérminer le meilleur arbre serait le bienvenue.

Merci
En cours, on vous a explique le principe du maximum de parcimonie et les criteres qui sont utilises pour determiner comment calculer le score de parcimonie a partir d'un alignement.
Il faut donc suivre ces indications pour trouver l'arbre le plus parcimonieux parmi les 3 proposes pour chaque alignement.

Pour la seconde question, il n'y a pas vraiment de technique. On vous demande de reflechir sur les arbres obtenus par les differentes methodes en tenant compte des avantages et inconvenients de chaque methode pour estimer le meilleur arbre a partir de ceux inferes avec les 16 proteines nucleaires concatenees. Toutes les informations necessaires a cette reflexion ont ete donnees lors des differents cours.

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