Tutorat en ligne de l'Agora du Département de biochimie: Banque de Questions/réponses : Impression

BCM-2003-A | Section Phylogénomique- Application d'outils bio-informatiques | Question #207

Envoyé par : Véronique Lisi Répondu par : Béatrice Roure  2005-02-12
Bonjour,
Lorsqu'on utilise le max. de vraisemblance, on obtient des valeus de vraisemblance qui sont le ln des valeurs réelles. Ces valeurs sont négatives. Est-ce que l'arbre qui a le plus de vraisemblance est celui le plus négatif (plus grande valeur absolue) ou bien celui qui a simplement la plus grande valeur?
Plus la valeur est proche de 0 plus la vraisemblance est grande : comme vous avez pu le voir au cours du laboratoire en faisant tourner PHYML, la valeur du logarithme de la vraisemblance se rapproche progressivement de 0 tandis le la topologie converge vers l'arbre le plus vraisemblable

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