Tutorat en ligne de l'Agora du Département de biochimie: Banque de Questions/réponses : Impression

BCM-2003-A | Section Phylogénomique- Application d'outils bio-informatiques | Question #211

Envoyé par : Steve Lawrence Répondu par : Béatrice Roure  2005-02-14
BCM2003 Exercice 3

Pour le nuc-16-prot. phy quels arbres doit je comparer

l'un phyml avec l'autre et les deux avec celui de bootstrap?

Cela dépend de la question posée :

- pour la comparaison 2 à 2 : on compare les 2 arbres obtenus avec phyml (bionj et mammalia.tre)

- pour la seconde question, on vous demande de reprendre tous les arbres inférés pendant les 3 séances à partir des séquences de protéines nucléaires concaténées; et d'estimer, en justifiant la réponse, quel est le meilleur parmi tous ces arbres


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