Tutorat en ligne de l'Agora du Département de biochimie: Banque de Questions/réponses : Impression

BCM-2003-A | Section Phylogénomique- Application d'outils bio-informatiques | Question #212

Envoyé par : Lilianne Dupuis Répondu par : Béatrice Roure  2005-02-15
Bonjour,
à propos de l'étude de saturation de la dernière scéance de laboratoire... Est-ce que mito-12tv.mat signifie qu'un poid plus grand a été donné aux tranversions survenant dans les positions nucléotides 1 et 2 ?

Merci, Lilianne
Tout d'abord, la matrice de distance est calculee a partir d'un jeu de sequences ne contenant que les positions 1 et 2 du codon. Puis seules les positions ayant subit une transversion sont prises en compte pour calculer la distance pour chaque paire de sequences.

De la meme facon, pour la matrice mito-3ts.mat, le calcul n'est fait que pour les 3eme bases du codon en subit une transition.

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