Tutorat en ligne de l'Agora du Département de biochimie: Banque de Questions/réponses : Impression

BCM-2003-B | Section Transcriptomique- Application d'outils bio-informatiques | Question #219

Envoyé par : Véronique Lisi Répondu par : Jean-Philippe Laverdure  2005-02-24
Disons qu'on fait une analyse HCL et qu'on choisit un nombre X de cluster et qu'on fait une analyse de neighboors avec encore X clusters (basés sur FOM), peut-on comparer ces deux analyses pour vérifier les clusters qui sont stables entre ces deux analyses?
Excellente question !
Il est en effet possible de faire des manipulations "ensemblistes" (union, intersection et XOR) à l'aide du cluster manager de TMeV:
Une fois que tu as "storé" tes clusters (option store cluster Vs save cluster) dans le cluster manager,
Tu n'as qu'a sélectionner les clusters sur lequels tu desires effectuer les operations et, a l'aide d'un click droit, choisis l'option "cluster operations" et l'opération de ton choix.
Le résultat génère un nouveau cluster que tu peux ensuite exporter en fichier texte à l'aide de la fonction "save cluster" pour les manipulations subséquentes !


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