Tutorat en ligne de l'Agora du Département de biochimie: Banque de Questions/réponses : Impression

BCM-2003-A | Section Phylogénomique- Application d'outils bio-informatiques | Question #467

Envoyé par : Étudiant(e) Bioinformatique Répondu par : Béatrice Roure  2008-01-23
Hello,
I have two question regarding the Devoire1. I would like to have some clarification on the notion of "protocole"! is it a list of steps that must be followed, backed up by justification, in order to determine to which category each sequence belongs? or will it have to be more detailed.

a bit of clarification is appreciated

Thank you

Bonjour,
C'est exactement ça. Un protocole expérimental doit permettre à une autre personne de reproduire les étapes qui conduisent aux résultats obtenus. Il est donc nécessaire pour chaque étape de préciser quel(s) outil(s) a(ont) été utilisé(s), avec quel(s) paramètre(s) et quelles données. La description peut être très simple, par exemple "gblocks avec les paramètres par défaut".
La justification d'une étape, ou d'un ensemble d'étapes, permet de suivre la logique du raisonnement qui a conduit à définir le protocole; par exemple "utilisation de gblocks avec les paramètres les moins contraignants afin de conserver le plus de positions possibles"
J'espère que cela répond à la question
Béatrice

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