Envoyé par : Geneviève
Répondu par : Jean-Christophe Grenier
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2009-02-04 |
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En essayant de construire les arbres consensus, je n'arrive pas à sauver mes arbres sous le format phylip pour les visualiser avec NJplot. Je peux donc visualiser les arbres dans la fenêtre et les enregistrer mais pas sous le format phylip. Contrairement à la fonction savetrees, il ne semble pas y avoir d'option format disponible pour cette commande. Peut-on sauver nos arbres en format phylip lorsqu'on fait des arbres consensus?
Merci |
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Comme j'avais mentionné au dernier cours, pour les arbres consensus, il est préférable de prendre le log de la sortie de Paup pour avoir l'arbre avec les valeurs sur les branches, tout comme pour les arbres de bootstrap.
Cependant, il est possible de visualiser la sortie d'un arbre consensus avec Dendroscope. Les valeurs sur les branches seront cependant inexistantes. Il faudra dans ce cas-ci prendre les valeurs de la sortie de Paup et les mettre manuellement sur l'arbre de Dendroscope. |
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