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BCM-1503
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Envoyée par : Diala ABD RABBO
Répondue par : Julien Desroches
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2005-03-07
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Question
#245
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Bonjour Prof.,
Est-ce que la seule différence entre la réparation d'une cassure d'un ADN par polymérase I (par déplacement, sens 5' -> 3') se fait par dNTPs sur le brin avancé et retardé et par la Ligase se fait par ATP juste sur le brin retardé? c'est quoi le dNTP?
les amorces sur les 2 brins (avancé et retardé) sont synthetisées par la primase ou il y a un enzyme pour sysnthétisé l'amorce sur le brin avancé et juste le primase pour le retardé?
Merci. |
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Réponse
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bonjour,
La réplication de l'ADN s'effectue par l'ADN polymerase III sur les deux brins (avancés et fragments d'Okazaki). L'ADN pol I sert à réparer les cassures dans l'ADN de façon générale. Au niveau de la réplication, l'ADN pol I enlève les amorces ARN et les remplace par des dNTP (désoxyribonucléotides tri-phosphates). Elle joue donc un rôle au niveau du brin retardé. La cassure restante est liée par la ligase.
La réplication de l'ADN par la polymérase III se fait sur les deux brins d'ADN antiparallèles selon deux mécanismes distincts. Le brin qui est répliqué de façon continue de 5' en 3' dans le sens du déplacement de la fourche de réplication se nomme le brin avancé. Il y a ajout de nucléotides (attaque nucléophilique du groupement 3' 0H du brin croissant sur le groupement phosphoryle alpha du dNTP, ce qui libère un PPi). Dans le cas du brin retardé, il est également synthétisé de façon discontinue dans le sens 5'-3', grâce aux amorces d'ARN. Ces amorces sont générées par l'ARN polymérase et par la primase chez E. coli pour le brin avancé et par la primase pour le brin retardé. L'ADN polymérase III se sert de ces amorces pour débuter la réplication et génère ainsi les fragments d'Okazaki. Également, les amorces d'ARN sont remplacés par de l'ADN par le mécanisme de déplacement de cassure par l'ADN pol I.
La polymérase I permet le déplacement d'une cassure d'ADN dans le sens 5'-3' grâce à ses activités combinées exonucléase et polymérase qui remplacent les nucléotides du côté 5' de la cassure. On appelle ce mécanisme nick translation, qui est en soit une technique pour incorporer des nucléotides radioactifs dans de l'ADN pour en faire une sonde. Les fragments d'Okazaki adjacents générés lors de la réplication du brin retardé sont séparés par une cassure. Ils sont liés entre eux par l'action de la ligase. Cette réaction enzymatique exige de l'énergie, fournie par l'hydrolyse de l'ATP en AMP + PPi.
Hors la réplication, il est à noter que ce déplacement peut avoir lieu sur les deux brins de l'ADN, toujours dans le sens 5'-3' et que la ligase peut jour son rôle sur les deux brins, lorsqu'il y a présence d'une cassure.
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