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BCM-2003-A
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Envoyée par : Isabelle Filiatreault
Répondue par : Béatrice Roure
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2008-01-30
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Question
#470
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Bonjour,
Je n'arrive à trouver, ni dans les notes de cours, la démo ou le manuel... ce que les scores "maximaux" donnés par "hsearch" représentent.
Ce score maximale qui est dans les valeurs de 1000 pour la parcimonie et 1-2 pour la distance du meilleur arbre. Je ne sais pas ce que ce nombre représence et si c'est une valeur arbitraire de PAUP basé sur la qualité de l'arbre ou bien si c'est vraiment une valeur qui veut dire quelqechose pour tout les logiciels comme une certaine valeur statistique tel que je CI.
Dans tout les cas, j'aimerais savoir ce que ces valeurs représente pour mieux les comparer, et avoir un intervalle de valeurs acceptables pour chaque métodes.
Merci
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Réponse
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bonjour,
Les scores représentent la taille de l'arbre, mais calculée différemment suivant la méthode d'inférence. Dans le cas des méthodes de distance, c'est le nombre moyen de substitutions. Dans le cas de la parcimonie, c'est la somme des états de caractères pour chaque position. La valeur est donc beaucoup plus grande dans le second cas. Les 2 scores ne représentant pas la même chose, il est impossible de les comparer directement.
Béatrice
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