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BCM-3514 Envoyée par : Etudiant(e) Sciences biologiques Répondue par : Marieke Rozendaal 2010-02-15
Question
#532
En ce qui concerne la technique 'extension d'amorce' pour l'identification de la transcription ; en quoi la taille du fragment radioactif obtenu devrait correspondre à la distance de la sonde à l'extremite de l' ADNc de depart ? L'amorce correspond-t-elle à la sonde ? Enfin, dans la diapositive 57 pour l'estimation de la taille des fragments sur gel apres migration, comment fais-t-on pour determiner le nombre de sites d'initiation ? MERCI
Réponse Bonjour,

La technique d'extension d'amorce est utilisée pour l'identification des sites d'initiation de la transcription. La taille de du fragment radioactif obtenu correspond à la distance de la sonde à l'extrémité de l'ADNc de départ si l’extrémité amont de l’ADNc correspond bien au site d’initiation de la transcription. Si par exemple il existe un deuxième site d'initiation plus en amont, on obtiendra un fragment plus long que la taille attendue. Dans tout ça la sonde = l'amorce marquée au P-32.
Pour la diapo 57, avec l'explication que je viens de donner, je pense que c'est clair que le nombre de produits obtenus de tailles différents correspond au nombre de sites d'initiation.
J'ajoute une figure pour clarifier le tout.

J'espère que cela répond bien aux questions. Si c'est toujours pas clair, n'hésites pas de poster une autre question!

Bonne continuation,
Marieke.

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