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Sélection actuelle : Toutes les sections
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Diala ABD RABBO
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-12
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Question
#208
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Bonjour,
Concernant la partie 3.3 pour la méthode de neighbor joining des 4 matrices, est ce qu'on choisit l'option de prendre 'Opossum' comme outgroup ou pas?
Merci  |
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Question consultée 5675 fois. | 4442 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Véronique Lisi
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-12
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Question
#207
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Bonjour,
Lorsqu'on utilise le max. de vraisemblance, on obtient des valeus de vraisemblance qui sont le ln des valeurs réelles. Ces valeurs sont négatives. Est-ce que l'arbre qui a le plus de vraisemblance est celui le plus négatif (plus grande valeur absolue) ou bien celui qui a simplement la plus grande valeur? |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Michaël Auger-Lafond
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-12
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Question
#206
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Puis-je avoir une explication de base sur l'exercice papier du dernier cours de phylogénie ?
De même, un exemple de la technique a utilisé pour dérminer le meilleur arbre serait le bienvenue.
Merci |
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Question consultée 5664 fois. | 4486 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Steve Lawrence
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-11
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Question
#205
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pour le exercise 3
quand je rentre "mammalia-mito.tre" dois je seulement changer l'option "u" ou changer tous les options comme dans"mito-12-prot.phy"
eg "D,I,M,R, A, N 0.3, Y"
Je l'essayais des deux facons et ca ma donnais
". Problem with sequence format"
merci
Steve
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Question consultée 5725 fois. | 4543 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Diala ABD RABBO
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-07
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Question
#204
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Bonjour Béatrice,
j'ai essayé de télécharger le treeview (32 bits) version 1.6.6 et quand j'execute le setup.exe programme, l'erreur suivante s'affiche 'le fichier système ne convient pas à l'execution des applications MS-Dos ou Microsoft Windows' et le titre de la fenètre qui affiche cette erreur est 'Sous système 16 bits' c'est comme si je télécharge celui du 16 bits, mais je suis sure que je télécharge celui de 32 bits. Vous pouvez l'essayer pour s'assurer.
Merci |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Diala ABD RABBO
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-07
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Question
#203
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Bonjour Béatrice,
J'en ai windows xp et j'ai essayé d'installer le program viewtree, pour pouvoir lire les valeurs de bootstrap car elles sont mal présenté sur njplot, mais ca se voit qu'il n'y a pas une version pour windows xp. Avez vous d'autre propositions?
Merci. |
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Question consultée 5705 fois. | 4572 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Véronique Lisi
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-07
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Question
#202
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Si un noeud a une robustesse de 100 mais que son sous-noeud n'a qu'une robustesse de 70, qu'est-ce que ça signifie? Est-ce que le noeud de 100 est aussi robuste qu'un noeud de 100 qui n'a pas de sous-noeud ou qui a un sous-noeud avec une valeur élevée de robustesse? |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Steven Lawrence
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-06
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Question
#201
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!) Question de vocab
vocabulaire : un noeud = une branche ou groupements de branches
"groups" = noeuds en anglais?
C'est correct?
2) pour le Compte Rendu : est-ce que un pourcentage de mieux que 50% signifie un noeud robuste?
3) Est-ce que je puisse utiliser les arbres trouver dans le "outfile" comme preuve de robustesse?
Merci pour toute votre aide je l'apprecie beaucoup!
Steve
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Question consultée 5569 fois. | 4461 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Véronique Lisi
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-06
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Question
#200
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J'utilise NJPlot sous Windows, est-il normal de ne pas avoir les valeurs de bootstrap sur mon arbre lui même. Je comprends que j'ai ces valeurs dans le fichier de sortie de "consense" mais je croyais les avoir aussi sur l'arbre. Se pourrait-il que l'arbre ait été mal bâtit?
Merci |
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Question consultée 5693 fois. | 4498 votes, Moyenne 3/5.0 |
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BCM-2003-A
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Envoyée par : Steve Lawrence
Répondue par : Béatrice Roure
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2005-02-06
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Question
#199
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avec l'exercice 2 section 5
Jukes et Cantor
Je comprends pas de tout ce que je dois faire a ce que ca signifie:
D = -3/4ln(1-4/3q)
si la frequence de differences est egale a 35 %
q = .35 ???
D =.4658 ou 46?
J'ai pas compris comment les equations dans les notes de Herve etaient derivee..(necessaire pour le question #2 odans le section 5 de l'exercice 2)..Est-ce-qu il'y'a un site web ou un livre qui pisse m'aider?
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