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BCM-2003 Envoyée par : Xiao Zhu Répondue par : Félix Doyon 2004-03-03
Question
#98
Pour la question 1 de la 2e partie du dev. 4 à remettre lundi le 8 mars (section "Construction de ...") qu'entendez vous par 'gap' = 1+k ? Que signifie donc le parametre k?

De plus, la question 2 de la 1ere section, faut-il qu'on ecrive l'algo (en pseudo-code) ou suffit-il tout simplement decrire comment il marche? 
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BCM-2003 Envoyée par : François Gauthier Répondue par : Félix Doyon 2004-03-01
Question
#97
Dans le deuxième partie du devoir #4, on mentionne au #2 de la section sur le calcul de la matrice de substitution que l'alignement local est explicité sur la figure 2. Or, il est explicité sur la figure 1 seulement. Je me demandais avec quelles figure il fallait travailler.

On demande aussi au #2 de décrire l'algorithme qui fera le prochain alignement sous-optimal et de déterminer les changements qui seront apportés aux valeurs de la table de programmation dynamique. Je ne comprends pas ce qu'il y a à changer dans la table puisque les calculs effectués doivent être valables peu importe l'alignement qu'on recherche.

Merci 
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BCM-2003 Envoyée par : François Gauthier Répondue par : Félix Doyon 2004-03-01
Question
#96
Pour la question #1 de la deuxième partie du devoir #4 portant sur l'algorithme de retraçage, est-ce qu'on doit faire un algorithme d'alignement local ou global avec/sans pénalité en bout de séquence?  
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BCM-2501 Envoyée par : Marie Mutabaruka Répondue par : Alexandre Viau 2004-02-23
Question
#94
Bonsoir,

J'aimerais savoir si vous pouviez m'éclairer en ce qui concerne l'attribution séquentielle, comment on fait pour déterminer quel acide aminé correspond à quel pic. merci d'avance.

Marie 
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BCM-2501 Envoyée par : Guillaume Brochu Répondue par : Alexandre Viau 2004-02-23
Question
#92
Comment fait-on pour déterminer entre quels acides aminés il existe un pont H dans le site actif d'un enzyme à partir d'un spectre RMN 2 dimensions ???

Merci 
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BCM-2501 Envoyée par : Jonathan Poulin Répondue par : Alexandre Viau 2004-02-23
Question
#91
Salut Alexandre,

Est-il possible de faire la distinction entre une hélice alpha et un feuillet béta par spectre COSY? 
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BCM-2501 Envoyée par : Alexandre Viau Répondue par : Alexandre Viau 2004-02-23
Question
#90
Bonjour à tous, voilà la première partie de mon résumé sur le spectre RMN 2D. La partie sur l'attribution séquentielle suivra sous-peu. 
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BCM-2501 Envoyée par : Fred Montpetit Répondue par : Alexandre Viau 2004-02-23
Question
#89
Bonjour,

lorsque j'analyse le graph (COSY,NOESY et TOCSY) d'une protéine, si celle-ci se lie à de l'ARN, est ce que cette liaison va nous faire perdre des interactions COSY et NOESY? Si ma protéine se lie à d'autres protéines, est ce qu'il peut y avoir problème d'aggrégation et ainsi nous empêcher de voir des interactions?

merci pour ton aide

PS. Ou peut-on voir ton document sur NOESY RELAY?

 
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BCM-2501 Envoyée par : Jordine Félix Répondue par : Alexandre Viau 2004-02-22
Question
#95
Bonjour,
Je voulais savoir, pourquoi c'est à une longueur d'onde de 220nm, que l'on peut differencier les hélices alpha des feuillets betas. Aussi, quelles sont les autres informations que l'ont peut tirer du dichroïsme circulaire?

Merci,
Notre examen est mardi le 24 février 
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BCM-2003 Envoyée par : Félix Doyon Répondue par : Félix Doyon 2004-02-20
Question
#86
Un étudiant a écrit:

"Bonjour,
Pour la question b, est-ce qu'il serait possible d'ajouter à l'énoncé les
deux formules pour les pénalités de 'gap' affine discutées en classe? Il
semble je ne les ai pas bien pris en note.
merci!" 
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